நாகார்ஜுனா இரண்டு திருமணங்கள் செய்துகொண்டார். முதலில் மணந்தவர் ராமாநாயுடுவின் மகள் லட்சுமி. இவர்களின் மகன் நாக சைதன்யா. திருமணமாகி நான்கு ஆண்டுகள் ஆன நிலையில், கருத்து வேறுபாடு காரணமாக இருவரும் பிரிந்தனர். 1992இல் நாகார்ஜுனா நடிகை அமலாவை இரண்டாவது திருமணம் செய்துகொண்டார்.